Systèmes microbiens.

consultez le site www.mbgae.org/SM/

Ce parcours est particulièrement original et unique

• dans l’offre régionale et nationale en offrant aux étudiants une formation théorique
• et par la recherche en microbiologie dans tous les aspects depuis les mécanismes génétiques et cellulaires, l’évolution, l’écologie (interactions et écosystèmes).[...]

Cette spécialité rassemble toutes les forces en enseignement et en recherche de ce domaine sur Montpellier en intégrant aussi des sites plus modestes comme Narbonne et Avignon, justifiant une co-habilitation UM 2, UM 1 et Montpellier SupAgro.

Comprendre le fonctionnement et le rôle des micro-organismes (définis comme les organismes essentiellement unicellulaires procaryotes et eucaryotes ainsi que les champignons et les virus) dans une approche intégrée comprenant les aspects cellulaires et moléculaires, les populations et communautés, les interactions avec les autres organismes, le rôle dans les écosystèmes et l’évolution.

Comprendre les facteurs environnementaux qui expliquent la dynamique et l’émergence de ces microorganismes en tant que pathogènes de l’homme, des animaux et des plantes.

Finalités

Objectifs (pédagogiques, scientifiques, professionnels)

a. Les objectifs pédagogiques du parcours SM sont de prendre en compte les systèmes microbiens dans une démarche intégrative abordant aussi bien l’étude des micro-organismes en tant que cellules, individus, populations et communautés que leurs interactions avec les autres organismes (homme, animal, plante) ou leurs rôles (biodiversité) dans le fonctionnement des écosystèmes. In fine, cet enseignement amène à une vision globale des micro-organismes en relation avec les environnements naturels souvent anthropisés et « modernes » (hôpital, ville, …), et de leurs réactions face aux modifications de ces environnements, notamment dans le contexte des changements globaux.

b. Les objectifs scientifiques sont de permettre aux étudiants

• d’aborder les différentes problématiques de la recherche en microbiologie en ayant une vision intégrative des systèmes microbiens, des interactions entre les individus jusqu’à l’échelle globale de leur fonctionnement.
• d’acquérir une formation théorique et pratique (par la recherche) leur permettant d’intégrer la vie active ou de poursuivre dans une formation doctorale appropriée

c. Les objectifs professionnels sont :

• De former à la recherche de futurs chercheurs et enseignants-chercheurs en microbiologie dans différentes thématiques (microbiologie des eaux ou des sols, écologie et évolution microbienne, santés publique, animale et végétale, …). L’originalité de cette formation repose sur une démarche interdisciplinaire de l’étude des systèmes microbiens. Cette formation de haut niveau peut conduire à préparer une Thèse de doctorat permettant d’intégrer la vie active soit dans le secteur privé soit dans les Universités et les organismes de recherche.

• De former des cadres supérieurs des entreprises (développement industriel ou biotechnologique) ou des administrations nationales et territoriales exerçant dans le domaine de la prévention sanitaire et de l’expertise (homme, animal, végétal), de l’agronomie, de la biodégradation des xénobiotiques et de la bioremédiation des écosystèmes, de l’aménagement et de la protection de l’environnement, des biotechnologies. Cette spécialité doit permettre de compléter la formation d’étudiants Ingénieurs, ou de permettre à des étudiants titulaires du Master Sciences pour l’Environnement spécialité BIMP de postuler à des Ecoles d’Ingénieurs spécialisées (i.e. Ecole Nationale de Santé Publique, …).

Compétences acquises

(scientifiques, professionnelles, méthodologiques …)

a. Connaissance des grandes questions actuelles en microbiologie environnementale et leurs enjeux,

b. Etre spécialisé dans les domaines des interactions microbiennes mutualistes ou pathogènes, du fonctionnement microbien dans les systèmes terrestres et aquatiques….,

c. Maîtrise des approches méthodologiques et conceptuelles utilisées en écologie microbienne,

d. Etre sensibilisé aux applications potentielles des microorganismes, à leurs intérêts et à leurs maîtrises dans les secteurs de l’environnement, de l’agronomie et de la santé publique,

e. Initiation à la recherche et à sa démarche, savoir utiliser les ressources bibliographiques, rédiger un rapport scientifique, et avoir acquis des méthodes pédagogiques de la communication écrite et orale.

Débouchés

La microbiologie représente des thématiques prioritaires reconnues sur le plan national et international. Aussi, le parcours Systèmes Microbiens assure des débouchés dans les grands organismes de recherche (Université, CNRS, INSERM, INRA, IRD, IFREMER, Institut Pasteur, Muséum d’Histoire Naturelle), l’industrie, les sociétés de biotechnologies, les cabinets d’expertise et les services publics ministériels et territoriaux pour l’aide à la décision.

Recrutement

Public Cible

Formations : Etudiants et professionnels de formation scientifique, médicale, pharmaceutique, vétérinaire, en rapport avec la microbiologie.

Bassin de recrutement : Les étudiants au niveau local peuvent venir de l’Université Montpellier II, l’Université Montpellier I et du Centre International d’Etudes Supérieures en Sciences Agronomiques. Au plan régional, ils peuvent venir de l’EPA universitaire de Nîmes ou de l’Université de Perpignan. Au plan national, cette formation est ouverte aux étudiants souhaitant se spécialiser en microbiologie provenant des différentes universités et écoles. Au plan international, la formation est ouverte aux étudiants suivant des cursus européens et aux étudiants des autres pays notamment les pays du Sud grâce à l’action menée par Agropolis international.

Une UE est mise en place dans chacune des années M1 et M2 pour aider les étudiants à définir leurs projets d’étude et professionnel et à les accompagner dans son élaboration et sa finalisation (Thèse, emploi).